2020年8同月11日，来自瑞典乌得勒大学的郭定西教授团队在Nature Communications上刊发篇文中Gut microbial co-abundance networks show specificity in inflammatory bowel disease and obesity的文中。
十二指肠有机物群是一个包括十分复杂基本粒子的生态系统。以外，研究成果管理人员对十二指肠有机物群在健康和营养不良里的作用的了解主要发挥作用并不相同的有机物同位素，而对有机物基本粒子在生命营养不良故事情节下的作用知之甚少。在这里，研究成果管理人员使用来自四个生命配置文件的2379个元基因小组构筑并尤其了有机物主导位素互联网：一个瘙痒性肠病(IBD)配置文件，一个心血管营养不良配置文件和两个基于人群的配置文件。研究成果管理人员见到，38.6%的类群主导位素和64.3%的闭环主导位素的其中心在配置文件密切关系不存在实着歧异，113个类群和1，050个闭环主导位素表明成IBD基因表达震荡，281个闭环主导位素表明心血管营养不良基因表达震荡。研究成果管理人员也可以在构建生命有机物小组(iHMP-IBD)项目的IBD配置文件的横向数据里解码这些IBD有机物主导位素。研究成果管理人员的研究成果确认了IBD和心血管营养不良的几个极为举足轻重类群和闭环，并提供了证据表明营养不良里有机物同位素的改变可以制约它们的主导位素人关系，这丰沛了研究成果管理人员以外对营养不良里有机物失调的认识。
十二指肠有机物主导位素互联网的构筑
研究表明，有机物都由和系统图谱在不小某种程度上是交叠的，尽管研究成果管理人员推论到IBD配置文件里的类群都由发生了实着变化。至少一个配置文件里>20%的样本里不存在的134个菌株种类和343个有机物闭环被纳入有机物互联网断定。研究成果管理人员融合SparCC和SpiecEasi方法确立了有机物主导位素人关系。
对于类群互联网，研究成果管理人员在LLD配置文件里确认了2604个主导同位素，在500FG配置文件里确认了1591个主导同位素，在300OB配置文件里确认了1107个主导同位素，在IBD配置文件里确认了2554个主导同位素，总共约归因于了3454个独特的类群主导同位素。值得注意的是，82.1%的类群主导同位素也体现成共约现。
对于闭环，主导位素的数目从500FG的37，279个到LLD的40，699个大概，总共约归因于了43，355个独特的闭环主导位素。
并不相同的有机物主导同位素看出在同位素水平上
当扫描包括可视主导位素的100个类群和304条闭环时，76%的类群和84%的闭环在配置文件密切关系的同位素水平也表明成实着歧异。这意味着可视的主导位素人关系在不小某种程度上看出在并不相同的有机物同位素上。研究成果管理人员总结了来自同一种属或来自并不相同种属的类群密切关系歧异主导位素的数目。主导位素异质性小得多的种属是细菌，不仅在并不相同的细菌密切关系推论到大量并不相同的主导位素，而且在细菌与其他种属的类群密切关系也推论到大量并不相同的主导位素，如真菌株和韦洛氏菌。在IBD配置文件里，细菌的种类较低，这与之前的研究成果结果一致。对闭环主导位素也见到了类似的推论，引人注意是肽链催化反应闭环，它不仅在自身内部，而且在与核苷和碱基催化反应无关的各种闭环方面也表明成社会性。
特定的有机物主导位素在营养不良配置文件里非金种属
研究成果管理人员研究了可视的主导同位素人关系确实由特定的配置文件驱动，即一个配置文件里的配置文件同位素其中心确实与其他三个配置文件里的配置文件同位素其中心有不小并不相同。有意思的是，与基于群体的配置文件相尤其，营养不良配置文件里的不相关的基因表达主导位素实着非金种属：113(94%)个类群主导位素和1050个(72%)闭环主导位素与IBD配置文件特异无关，281个(19.4%)闭环主导位素与300OB配置文件特异无关，相尤其之下，只有3个类群和117条闭环的主导同位素人关系嗣后种属于基于种群的配置文件LLD和500FG。研究成果管理人员的结果强调了有机物的主导同位素取决于寄主的健康和营养不良状况。
IBD里的有机物主导位素互联网
在构建生命有机物小组项目(iHMP-IBD)配置文件里解码IBD互联网：在研究成果管理人员的IBD配置文件里确立的2554个类群和37，699个闭环主导位素里，研究成果管理人员尽可能评量iHMP-IBD39里77个IBD形态里的2090个类群主导位素和37，106个闭环主导位素。类群主导同位素的相对较低解码率在不小某种程度上是一个功率问题，因为研究成果管理人员还推论到，1705(81.6%)个类群主导同位素和24，165个(65.1%)闭环主导同位素在研究成果管理人员的IBD配置文件和iHMP-IBD配置文件密切关系的主导同位素其中心没有人实着歧异。然后，研究成果管理人员尤其了iHMP-IBD配置文件第一个和最后一个时长点(相隔~1年)密切关系的IBD互联网，解码了90.6%的类群主导位素和99.6%的闭环主导位素。这表明，研究成果管理人员对IBD主导位素其中心的估计在并不相同的配置文件里不小某种程度上是可重复的，并且随着时长的很短是安定的。
IBD的有机物互联网与营养不良相似性的人关系：以前的研究成果表明，推论到的有机物同位素歧异可以用IBD14的某些营养不良相似性来解释。因此，研究成果管理人员假设同源同位素人关系也意味著是这种意味著。研究成果管理人员评量IBD主导位素确实与营养不良变异[溃疡性小肠炎(UC，n=189)与克罗恩病(CD，n=276)]、营养不良肺脏[回肠(n=212)与小肠(n=286)]以及营养不良活动[瘙痒(n=121)与非瘙痒(n=377)]无关。大多数主导位素人关系在营养不良相似性密切关系是可比的，只有少数在FDR
与药物无关的IBD有机物互联网：研究成果管理人员进一步测试了药物使用确实会制约有机物主导位素，因为IBD病患使用青霉素(20.0%)和质子泵抑制剂(PPI；26.5%)略低于普通人群配置文件(1.1%和8.4%)。研究成果管理人员见到青霉素用家和非青霉素用家密切关系的类群主导位素没有人实着歧异，而在37，959(3.7%)条闭环主导位素人关系里，有1049条(3.7%)的闭环主导位素人关系在PPI用家和非用家密切关系表明成总和上的实着歧异，引人注意是与异戊二烯催化反应和甲基赤藓砂糖醇磷酸闭环有关。
IBD里的极为举足轻重类群和闭环：当将IBD里的有机物主导位素与其他3个配置文件进行尤其时，研究成果管理人员确认了113个类群主导位素和1050个路径主导位素，与其他3个配置文件相尤其表明成实着并不相同的制约。然后，研究成果管理人员评量这些IBD基因表达主导位素确实与意味著与营养不良无关的特定闭环或类群高度无关24，研究成果管理人员的研究确认了IBD的三个极为举足轻重类群和四个极为举足轻重闭环。
课题菌种为酿酒酵母、产状青草细菌和格雷文尼茨放线菌。酿酒酵母和产甲氧菌早先曾与IBD14，41-45无关。有意思的是，酿酒酵母与具备促炎种属性的类群(如碎裂细菌)表明成自始的主导位素人关系，而与具备抗炎种属性的类群(如普氏镰刀菌)表明成负的主导位素人关系。
IBD的极为举足轻重闭环包括C1化合物借助和同化闭环、两条维生素催化反应闭环和肽链催化反应闭环。IBD里最极为举足轻重的系统闭环是硫化氢TCA循环闭环(P23-pwy)，它有76个IBD基因表达主导位素，其里94.7%在iHMP-IBD配置文件里解码。硫化氢TCA循环是一条二氧化碳通常闭环，已被指出是生产线用于砂糖、布氏、肽链、硫和菜醌催化反应的有机分子的更早闭环。
尽管IBD里这一闭环的同位素较高，但IBD里这一闭环的主导位素人关系(r=0.1)弱于其他配置文件(r=0.3)。研究成果管理人员见到IBD病患里18.8%的菜醌催化反应闭环是由酿酒酵母贡献的，是两个人群配置文件的2倍。这一见到表明，酿酒酵母是IBD里菜醌催化反应的举足轻重贡**，这才会加强其他有机物的落叶。事实上，研究成果管理人员的研究成果还断定出了酿酒酵母是IBD的极为举足轻重类群，与15个类群体现成IBD特有的主导位素人关系。其里，与瘙痒无关的细菌种类有要强的自始无关性，包括碎裂细菌、前庭细菌和婴儿细菌。因此，与其他配置文件相尤其，IBD病患的菜醌催化反应与细菌种类密切关系的无关性较低。
300OB里的有机物主导位素互联网
300OB互联网在LLD心血管营养不良形态里的解码：在300OB配置文件里检验到1107个类群和37，886个闭环主导位素。这些估计的主导位素其中心在LLD配置文件里成年人和体重指数(BMI)匹配的134名心血管营养不良者里大部分可解码，991(89.5%)种主导位素和32，963(87.0%)闭环主导位素表明没有人歧异。
与心血管营养不良无关营养不良无关的有机物互联网：300OB配置文件是为了研究成果心血管营养不良个人的冠心病而设的，其里包括139名横膈膜粥样硬化黑斑病患和159名心血管营养不良对照。此外，35名300OB大多数人患有砂哮喘。在这里，研究成果管理人员只推论到三种与冠心病无关的类群主导位素，所有这三种类群在有黑斑的病患里都表明成比没有人黑斑的病患更强的主导位素。
心血管营养不良的极为举足轻重闭环：当研究成果管理人员尤其300OB和其他3个配置文件里的有机物主导位素时，研究成果管理人员确认了281个闭环主导位素，它们表明成实着并不相同的制约，即心血管营养不良基因表达主导位素。心血管营养不良的一个极为举足轻重闭环是尿囊素的降解，它表明了85条闭环的心血管营养不良基因表达主导位素人关系。尿囊素是多种动植物(如山药)里的活性成分之一，被见到具备加强本品分泌和降低血砂糖的作用。其降解产物青草酸在青丙酮酸酯/天冬氨酸肽链里起抑制作用。与此相一致，研究成果管理人员见到尿囊素降解闭环与青丙酮酸/天冬氨酸(包括小组氨酸、高丝氨酸、甲硫氨酸、苏氨酸和异亮氨酸)的催化反应闭环和天冬氨酸的催化反应闭环呈较佳的负无关，两者外与空腹血砂糖水平呈自始无关，与空腹本品水平呈负无关。
更早成处：
Lianmin Chen, Valerie Collij, Martin Jaeger, et al.Gut microbial co-abundance networks show specificity in inflammatory bowel disease and obesity.Nat Commun. 2020 Aug 11;11(1):4018. doi: 10.1038/s41467-020-17840-y.
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