Sci Adv:没有证据支持哺乳动物中病菌表观遗传标记的存在

2022-01-03 01:34:24 来源:
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评注:在早期阶段,有机物就开始了在不改变酵母菌蛋白质DNA组织顺序的之前提下来使其DNA发挥完全相同的功能,而这就是通过给DNA亚基上去除化学标记来做到的。DNA磷酸化是两栖类的关键表观遗传学的系统会,其之中5-甲基胞嘧啶(5mc)是最常见于的DNA粘贴之一。6mdA是酵母菌限制性粘贴系统会的基本组成成分,现有在两栖类之中缺乏据信的限制性粘贴系统会。先之前有不少现代科学研究报道,6mdA也长期存在于两栖类之中,但并无证据背书。

已对,在《现代科学进展》上的一项现代科学研究之中,瑞典林雪平大学的现代科学研究技术人员确实,两栖类蛋白质之中长期存在酵母菌表观遗传学标记很确实被废料了,并且没有人充分的证据来断言两栖类之中长期存在这种粘贴。

N6-甲基腺嘌呤(6mdA)是酵母菌之中广泛的DNA粘贴,但最近在两栖类DNA之中也得到了表征。然而,现代科学研究技术人员说,即使对来自完全恰当两栖类蛋白质类型的DNA完成的6mdA可视和丰度量度现代科学研究也不恰当。

为了大幅度阐明6mdA在两栖类谱系性能指标之中的作用,现代科学研究技术人员利用了体外将进化幼稚T借助于(NTH)蛋白质分化为TH蛋白质亚群的技能。但是,与先之前的现代科学研究相反,他们发现TH分化过程之中6mdA的丰度没有人全局变动,并且辨别到分化的T蛋白质之中的6mdA程度与仍未磷酸化的全测序扩增DNA完全恰当,这确实6mdA并仍未以可监测的程度长期存在进化T蛋白质之中。

他们还分析了从六个进化蛋白质系之中分离出的DNA之中的6mdA,并核对出两个具有高于背景噪声程度的6mdA程度的蛋白质系。差一点的是,两种单独的293T蛋白质系培养物具有完全相同的6mdA程度,这确实现代科学研究技术人员辨别到的6mdA频率并非蛋白质类型本身固有的。确实,当他们大幅度看时,他们发现两条6mdA程度急剧下降的蛋白质系被感染性归入废料,感染性归入一种常见于的酵母菌蛋白质培养物之中矿物质6mdA的废料物。当他们用感染性特异性抗生素Plasmocin处理蛋白质系时,6mdA频率降低为A阴性对照。

“我们预见通过这些技术监测到的6mdA'频率'只是噪声。但是,由于一些十分复杂的技术问题,几种方法之中的背景噪声不是随机的,而是真实频率。”低阶作者Colm Nestor(洛德沃·内斯特)在一份声明之中话说。

现代科学研究技术人员分析了那时候通过DNA免疫沉淀测序、质谱和单分子数据处理测序在两栖类蛋白质之中定位或监测6mdA的努力。人们发现每种方法都有在实践中或缺陷,使表观遗传学标记的假无症状发现百余人较高,显然确实林雪平现代科学研究技术人员认为不长期存在这种物理现象的证据。

这组作者说:“我们断言,RNA和酵母菌废料、突变交叉反应性和其他技术限制的紧密结合已导致6mdA在两栖类DNA之中的一一错误标识。随着DNA和RNA粘贴家族的不断增长,以及那时候仍未知粘贴的丰富性越来越罕见,即使用于多种互补方法,我们也务实了错误发现的风险。我们劝告用于粘贴和仍未粘贴的测序DNA标准作为将来对比较丰富DNA粘贴的现代科学研究的最低尽快,以及在用于之前更全面地验证突变特异性。”

内斯特补充话说,现代科学研究技术人员在现代科学研究极为罕见的物理现象时必须极为不慎,考虑用于哪种方法,并回避他们是否毫无疑问在衡量长期存在的事物。他话说:“现在我们可以毫无疑问地话说两栖类之中不长期存在6mdA。关于6mdA,如果现代科学研究技术人员停止现代科学研究显然不长期存在的刚才,则可以更少大量时间和金钱,并且避免了很多令人失望的事情。”

原始出处:

Karolos Douvlataniotis, Maike Bensberg, Antonio Lentini, et.al. No evidence for DNA N6-methyladenine in mammals. Science Advances 18 Mar 2020: Vol. 6, no. 12, eaay3335

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